区别于常规课堂教学，本自然科学课程构建了三维立体教学体系。课程设置包含实验室模拟操作、生态园区实地考察、数据建模分析三大实践模块，每学期安排不少于20课时的户外教学活动。
| 教学模块 | 主要内容 | 课时占比 |
| 实验室探究 | 物质反应实验/微生物培养 | 40% |
| 户外考察 | 湿地生态监测/土壤采样 | 35% |
| 数据分析 | 实验数据处理/建模推演 | 25% |
课程设计采用主题式教学法，每个教学单元围绕特定环境问题展开。例如在水质研究专题中，学生需要同时运用化学检测方法、生物多样性分析、物理净化原理等跨学科知识，建立完整的问题解决方案。
课程配备专业级实验器材，包括便携式水质检测仪、电子显微镜、光谱分析仪等设备。教学团队由8名具有环境科学领域研究经验的教师组成，其中5人持有博士学位。
实践基地包含3处生态保护区观测站、2个校企合作实验室，确保学生能够接触真实科研环境。每学期组织2次学术沙龙，邀请中科院相关领域专家进行专题研讨。
